3D Biyobaskı işleminde ilk adım baskısı gerçekleştirilecek scaffoldun (doku iskelesi; porlu yapıya sahip biyouyumlu, biyobozunur, mekanik dayanımı güçlü olan üç boyutlu iskele) tasarımının yapılmasıdır. Tasarımlar Solidworks, Fusion360 gibi bilgisayar destekli tasarım (CAD) programları kullanılarak yapılabilir. İkinci adım ise tasarlanan modelin 3D Biyoyazıcının anlayacağı dile çevrilmesini sağlayan dilimleme adımıdır. Bu aşamada Cura, Simplify3D gibi çeşitli slicer (dilimleyici) yazılımları kullanılabilir. Bu dilimleyici yazılımlar, yapılan scaffold tasarımını 3D biyoyazıcının anlayacağı kod yapısı olan gcodelara dönüştürür. Dilimleme programları doku iskelesinin iç geometrisini, dış yapısını, hidrojelin akışını, baskı hassasiyetini, cihazın hızını ve birçok parametreyi belirlememizi sağlamaktadır. Gcodelara dönüştürülen 3D model, USB kablosu yahut SD kart ile biyoyazıcıya aktarılmaktadır. Üçüncü adım ise uygun biyomürekkep seçimidir. Biyomalzeme seçimi, taklit edilecek dokunun içeriği ile uyumlu olacak şekilde seçilir. İkinci prototipimiz olan GBA SPC1 model biyoyazıcımızda doğal ve sentetik polimerler ile scaffold basımı gerçekleştirmekteyiz. Scaffold basımında porlu yapının korunması, hücrelerin iskele içinde çoğalması için önemlidir. Biyobasım sürecinde 3D biyoyazıcı, mevcut doku mühendisliği yaklaşımlarından farklı olarak arzu edilen scaffold tasarımının hassas bir şekilde porlu yapıda basımını sağlayan özelleştirilmiş bir 3D baskı yaklaşımıdır. Fotoğraflarda farklı doluluk oranları ile basılmış scaffold örnekleri verilmiştir.